台大雲林分院斗六與虎尾二院區相距約15公里，車程約20分鐘，虎尾院區的啟用深化本地醫療服務的寬度與深度；秉承台大醫院「健康至上、生命無價」的價值觀，臺大醫院雲林分院斗六院區自93年4月改制成立後，以滿足當地醫療需求作為發展重點，積極購置所需設備及派遣專科醫師人力及購置心導管、核磁共振、斷層掃瞄等重大儀器，陸續完成各式開心手術、腹腔鏡肝癌切除手術等重大醫療服務，在以病人為中心下完成急診、加護病房、檢查區等院內整修工程為民眾提供高品質的服務及優質的就醫環境。

       此外，虎尾院區於96年10月啟用後，除斗六院區現有對於民眾醫療所需之呼吸照護病房、呼吸照護中心、精神醫療、復健設備與護理之家等各類醫療服務，已成立的心臟血管中心及肝膽中心之外，本院更積極發展急診重症中心、器官移植中心及腫瘤中心。主要提供腫瘤醫學治療，未來特別之設置有腫瘤放射治療專用的直線加速器、門診化療區、腫瘤專屬病床及癌末病人安寧病房。

       對雲林縣及附近地區民眾將可就近受到更高品質的醫療服務，無需再奔波至外縣市就醫，同時也能夠及時挽救生命健康；對守護地區民眾的健康台大雲林分院斗六、虎尾院區責無旁貸，肩扛重責貼心呵護您的生活。於教學研究上特於院區內成立共同實驗室提供醫學研究環境，強化二院區經營朝全方位醫療機構發展；全體職員共同參與醫療照護為提供民眾更多元的醫療服務，於95年成立健康管理中心，深入服務民眾對於健康預防之需求，本院所有同仁將持續本著視病猶親，一步一腳印的服務精神，讓病患獲得與台大醫院同品質的服務，成為一所雲林縣及附近地區民眾最信賴的醫院。